生物化学的核心

BioID是一种基于邻近依赖生物素化BioID资源筛选候选蛋白质-蛋白质相互作用的新方法。

核心将在以下方面提供协助:

• 项目设计
• bioid融合蛋白的检测
• 生物融合蛋白表达细胞的建立与检测
• 大规模生物id下拉
• 安排用质谱法鉴定候选人
• 数据分析

• Agilent 7890A气相色谱仪
• 安捷伦5977B质谱系统
• Luminex 200多重蛋白质分析系统
• Nicoya OpenSPR(表面等离子体共振)
• Bio-Rad ChemiDoc MP成像仪
• LiCor奥德赛Fc成像仪
• BioTek Cytation 3细胞成像多模式阅读器

• May DG, Scott KL, Campos AR, Roux KJ。BioID和TurboID在蛋白质近距离生物素化中的比较应用。细胞．2020; 9 (5): E1070。2020年4月25日发布。PMID:32344865
• Sears RM, May DG, Roux KJ。BioID作为活细胞中蛋白质接近标记的工具。方法Mol Biol．2019; 2012:299还是313。PMID:31161514
• 祝DG, Roux KJ。生物id:一种生成蛋白质关联历史的方法．方法Mol Biol．2019; 2008:83还是95。PMID:31124090

• 侯赛因年代，Bedekovics T，刘问，胡女士，全H，约翰逊SH，Vasmatzis G，可能DG，Roux KJ，Galardy PJ．UCH-L1绕过mTOR促进蛋白质生物合成，是小鼠myc驱动的淋巴瘤所必需的。血。2018年12月13日;132(24):2564-2574。

• Brudvig JJ，该隐JT，Schmidt-Grimminger GG，Stumpo DJ，Roux KJ，Blackshear PJ，魏玛JM．MARCKS是Netrin-DCC信号传递和胼胝体形成的必要条件。摩尔一般。2018年11月,55(11):8388 - 8402。
• Roux KJ，金正日迪，伯克B，可能DG．BioID:蛋白质-蛋白质相互作用的筛选。Curr Protoc Protein科学2018年2月21日;91:19.23.1-19.23.15。

• 比兰德拉Kc，可能DG，本森BV，金正日迪，Shivega工作组，阿里MH，Faustino RS，坎波斯基于“增大化现实”技术，Roux KJ．VRK2A是一种a型层蛋白依赖性核膜激酶，可磷酸化BAF。Mol Biol细胞。2017年8月15日;28(17):2241-2250。
• 该隐JT，金正日迪，Quast米，Shivega工作组，帕特里克RJ，莫泽C，路透社年代，佩雷斯米，迈尔斯一，魏玛JM，Roux KJ，Landsverk米．PHOX2B外显子1的无义致病变异导致先天性中枢性低通气综合征的转译再启动。我J医学热内A。173年5月,2017(5):1200 - 1207。

• 金正日迪，詹森SC，高贵的KA，KC B，Roux KH，Motamedchaboki K，Roux KJ．一种用于BioID接近标记的改进小生物素连接酶。Mol Biol细胞。2016年4月15日;27日(8):1188-96。
• 金正日迪，詹森SC，Roux KJ．用BioID识别核膜上的蛋白质-蛋白质关联。方法Mol Biol。2016; 1411:133-46。
• 被AA，安德森猕，Roux KJ．lamin相关蛋白的生物id鉴定。Enzymol方法。2016; 569:3-22。
• 对BJ，Neuharth年代，金正日迪，Amolins兆瓦，Motamedchaboki K，Roux KJ，主席PF．氧化还原和葡萄糖依赖性Txnip蛋白相互作用的鉴定。oxidmedcell longv。2016; 2016:5829063。
• 金正日迪，比兰德拉KC，朱女士，Motamedchaboki K，Doye V，Roux KJ．用邻近依赖生物素化方法探测核孔复合体结构。美国国立自然科学研究院。2014 6月17日;111(24):E2453-61。

BioID是一种在活细胞中筛选近似蛋白和相互作用蛋白的方法。这是通过混杂的生物素连接酶(我们称之为BirA*)与感兴趣的蛋白质(诱饵)融合来实现的，以便在活细胞中表达。添加过量的生物素可使饵料附近的内源蛋白质高效生物化。这些生物素化蛋白(称为候选蛋白)可以通过荧光显微镜或Western blot分析进行监测，并通过质谱分离进行鉴定。候选饵的生物学相关性随后可以通过各种常规方法进行验证。